Καλώς ορίσατε

στην ιστοσελίδα του Δημοκριτείου Πανεπιστημίου Θράκης για το ELIXIR-GR.

Το ELIXIR-GR αποτελεί τον ελληνικό εθνικό κόμβο του ESFRI European RI ELIXIR, μιας κατανεμημένης ηλεκτρονικής υποδομής που στοχεύει στην οικοδόμηση μιας βιώσιμης ευρωπαϊκής υποδομής βιολογικών πληροφοριών. Το ELIXIR-GR υποστηρίζει την έρευνα στις επιστήμες της ζωής και την εφαρμογή τους στην ιατρική, τις βιοεπιστήμες και την κοινωνία. Προσφέρει έναν κατάλογο εργαλείων, υπηρεσιών και αναφορών για μέτρηση επίδοσης , εξασφαλίζοντας βέλτιστες πρακτικές, βιωσιμότητα και διαλειτουργικότητα με άλλες υποδομές βιολογικών και ιατρικών επιστημών.

Το Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης συμμετέχει ως κόμβος του ELIXIR-GR, εστιάζοντας στην ανάπτυξη αλγορίθμων και διοχετεύσεων γονιδιωματικής ανάλυσης, με εφαρμογή στον άνθρωπο, στα ζώα και στα φυτά.

Παρουσία στο συνέδριο ΕΕΒΜΒ 2019

41ο Ετήσιο Συνέδριο της Ελληνικής Εταιρείας Βιοχημείας και Μοριακής Βιολογίας. 29 Νοεμβρίου - 1 Δεκεμβρίου 2019, Αθήνα, Ελλάδα.

Παρουσία στο συνέδριο ΕΕΒΕ 2019

41ο Ετήσιο Συνέδριο της Ελληνικής Εταιρείας Βιολογικών Επιστημών. 9-11 Μαΐου 2019, Κατερίνη, Ελλάδα.

Παρουσία στο συνέδριο ECCB 2018

17ο Ευρωπαϊκό Συνέδριο Υπολογιστικής Βιολογίας. 8-12 Σεπτεμβρίου 2018, Αθήνα, Ελλάδα.

Παρουσία στο συνέδριο ΕΕΒΜΒ 2018

69ο Πανελλήνιο Συνέδριο Ελληνικής Εταιρείας Βιοχημείας και Μοριακής Βιολογίας. 23-25 Νοεμβρίου 2018, Λάρισα, Ελλάδα.

Παρουσία στο συνέδριο ΕΕΒΕ 2018

40ο Ετήσιο Συνέδριο της Ελληνικής Εταιρείας Βιολογικών Επιστημών. 24-26 Μαΐου 2018, Βέροια, Ελλάδα.

Τα έργα

Σε αυτήν την ενότητα παραθέτουμε τα προγράμματα που υποστηρίζονται από το ELIXIR-GR. Μπορείτε να τα επισκεφθείτε πατώντας πάνω στα ονόματά τους.

PCA SNPs

Ο αλγόριθμός μας για την ταυτοποίηση SNPs που συσχετίζονται με την καταγωγή μέσω PCA. Λαμβάνει ως είσοδο ένα μητρώο από SNP και παράγει μια βαθμολόγηση για κάθε SNP. Τα SNP με την υψηλότερη βαθμολογία φέρουν την κυριότερη πληροφορία για την αναπαραγωγή της δομής του πληθυσμού.

VariantRanker

Performs ranking of variants in genomic datasets, integrating information from multiple sources to prioritize each variant by its deleteriousness, novelty and existing information.

NetworkAnalyzer

The Network Analyzer is a tool to visualize the output from the database for annotation, visualization and integrated discovery (DAVID, https://david.ncifcrf.gov) in order to reveal overlapping biological connections for a list of relevant genes.

GWAS Pipeline

Implementing genomewide association studies for the identification of genes that underlie disease – educational material.http://genomap.mbg.duth.gr/index.php/23-educational-material

Μεταγραφωμική

Υπό κατασκευή

Βιοδείκτες μη κωδικεύοντος RNA

Πιλοτική μελέτη για εύρεση βιοδεικτών από ncRNA. Λειτουργικός σχολιασμός επιγενετικών και μεταγραφικών ρυθμιστικών παραγόντων. Εξαγωγή μοριακών υπογραφών. Διαλεύκανση των ρυθμιστικών μονοπατιών στην ομοιόσταση και την κακοήθεια.

Η ομάδα

Τα μέλη της ομάδας του κόμβου του Δημοκριτείου Πανεπιστημίου Θράκης.

Galanis

Αλέξης Γαλάνης

Αναπληρωτής Καθηγητής ΔΠΘ

Επιστημονικά Υπεύθυνος Έργου / Οργάνωση, Παρακολούθηση και Συντονισμός λειτουργίας Υποδομής, Σύνταξη εκθέσεων πεπραγμένων, προβολή, δημοσιότητα
agalanis at mbg.duth.gr

Paschou

Περιστέρα Πάσχου

Αναπληρώτρια Καθηγήτρια ΔΠΘ

Συμβουλευτικός ρόλος / Συμμετοχή στη σύνταξη της τελικής έκθεσης πεπραγμένων
ppaschou at mbg.duth.gr

Papageorgiou

Αριστοτέλης Παπαγεωργίου

Αναπληρωτής Καθηγητής ΔΠΘ

Συμμετοχή στην ανάπτυξη και λειτουργία της υποδομής
apapage at mbg.duth.gr

Tsetsos

Φώτιος Τσέτσος

Εξωτερικός συνεργάτης, Μεταδιδάκτορας

Συμμετοχή στην ανάπτυξη, λειτουργία, και δημοσιότητα της υποδομής.
ftsetsos at mbg.duth.gr

Αλέξανδρος Δημόπουλος

Εξωτερικός συνεργάτης, Μεταδιδάκτορας

Συμμετοχή στην ανάπτυξη, λειτουργία, και δημοσιότητα της υποδομής.

Ειρήνη Λιάμπα

Εξωτερική συνεργάτιδα

Συμμετοχή στην ανάπτυξη, λειτουργία, και δημοσιότητα της υποδομής.

Χαβιέ-Έκτωρ Δελαστίκ

Εξωτερικός συνεργάτης

Συμμετοχή στην ανάπτυξη, λειτουργία, και δημοσιότητα της υποδομής.

Απόστολος Μανώλης

Εξωτερικός συνεργάτης

Συμμετοχή στην ανάπτυξη, λειτουργία, και δημοσιότητα της υποδομής.

Μαρία Μαρκάκη

Εξωτερική συνεργάτιδα, Μεταδιδάκτορας

Συμμετοχή στην ανάπτυξη, λειτουργία, και δημοσιότητα της υποδομής.

Μαργαρίτης Τσιφιντάρης

Εξωτερικός Συνεργάτης

Συμμετοχή στην ανάπτυξη, λειτουργία, και δημοσιότητα της υποδομής.

Επικοινωνία

Δεδομένης της φύσης της υποδομής του ELIXIR-GR, η επικοινωνία μαζί σας είναι σημαντική για εμάς. Αν έχετε οποιαδήποτε απορία για το ELIXIR-GR ή αντιμετωπίζετε κάποιο πρόβλημα με τις υπηρεσίες μας, παρακαλώ επικοινωνήστε μαζί μας χρησιμοποιώντας την κάτωθι φόρμα.

  • Διεύθυνση

    Κτίριο Φώτης Καφάτος
    Πανεπιστημιούπολη, Δραγάνα
    Αλεξανδρούπολη
    Ελλάδα
  • Ακολουθήστε το ELIXIR-GR